たまに参考にしてくださる方がいらっしゃるので，もう少し整理しておきます．
（読みづらい記事で申し訳ありません．．．）

この記事では，
・php-commonを消去
・php-gdを導入
・php（標準リポジトリ）を再度導入
・アップロード上限の変更
という作業を行っています．

php-commonを消したりややこしいことが必要だなーという感じかもしれませんが，
実際に必要なのは，「php-gd」の導入です．

なんでこんな複雑になっているかというと，サーバーを構築した当初，phpの最新バージョン（5.4.10）を入れたためです．
導入しようとしているphp-gdに適合するphpのバージョンが違いますよ，とそんな感じです．

Requires: php-common(x86-64) = 5.3.3-23.el6_4
Installed: php-common-5.4.10-1.el6.remi.x86_64 (@remi)

ここらへんのエラーメッセージの通りですね．

php-gd入れるために，phpを標準リポジトリ版に戻した次第です．
まぁphp5.4.10をインストールするは，標準ではなくRemiリポジトリを指定しなければならないため，
意図的にこういったことをしない限り，前半の作業は不要なんじゃないかなと思います．